鳄类、鸟类、恐龙类和翼龙类隶属于初龙次亚纲（Archosaurs），而鳄类与鸟类又是初龙次亚纲孑遗类群。鳄形动物与鸟类的最近共同祖先起源于三叠纪中期（约2.4 亿年前），与现生鳄目最近缘鳄形化石是也位于80至90百万年前的白垩纪。因此，鉴于进化史上具有独特地位，现生鳄目的系统分类、古气候学、古生物地理学、群体遗传学等内容成为鳄类进化研究的热点。

近期，我司潘涛博士在国际知名学术期刊《Zoological Journal of the Linnean Society》（林奈动物学报）发表学术论文，题为“Near-complete phylogeny of extant Crocodylia (Reptilia) using mitogenome-based data”。该刊物为中科院分区动物学一区TOP期刊。潘涛博士为第一作者，吴孝兵教授为通讯作者，太阳成集团tyc539为第一作者单位及通讯作者单位。江欣月、欧阳佳慧和邓友鹏三位本科同学参与该论文中的数据整理工作。该论文与缪家顺博士、张华彬博士合作完成，其为本文的并列一作。

该研究，以19种鳄目物种Illumina测序数据为基础，组装其线粒体基因组数据，并整合数据库已有基因组数据，重建现生鳄目经典分类体系下的所有物种高分辨率系统发育和演化历史。研究表明：鳄目共祖时间（TMRCA）发生在上白垩纪（86.75 Mya），鼍科的最近共同祖先的估计时间为53.33 Mya，鳄科和食鱼鳄科的共祖时间为50.13 Mya，提示其多样性可能与古新世晚期和始新世早期的气候变化密切相关。同时，该结果也提示多样化速率增加起始于始新世晚期（约36 Mya），并存在两个多样化高峰期（0-10 Ma和10-20 Ma）。气候波动可能在鳄目物种的成种演化中起着决定性的作用。

以上论文受到国家自然科学基金（No.31872253，32000355）、安徽省自然科学基金（1908085QC127）、太阳成集团tyc539高层次人才启动经费等基金支持。

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https://academic.oup.com/zoolinnean/article-abstract/191/4/1075/5868621?redirectedFrom=fulltext