近期,太阳成集团tyc539青年教师申涛博士在国际知名学术期刊《Frontiers in Molecular Biosciences》(IF=6.113,中科院2区)上发表题为“Characterizing the Molecular Heterogeneity of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Subgroups Classified by miRNA Expression Profile”的研究论文,申涛博士为第一作者及通讯作者,中国科学技术大学宋莹东硕士为共同通讯作者,中国科学技术大学汪香婷研究员为该工作提供了重要的帮助。太阳成集团tyc539为第一作者单位。
肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是最常见的肾脏恶性肿瘤亦是全球十大最常见的癌症之一。目前,靶向治疗仍然是针对肾透明细胞癌治疗的一线治疗方法,诸如针对mTOR和 RTK信号通路的靶向治疗也确实显示过较好的结果。然而不幸的是,并不是所有的患者都对这些治疗敏感,并且随着时间的推移,越来越多的证据显示针对这些靶点的靶向药物逐渐产生了耐药性。因此,针对ccRCC的治疗迫切的需要新的方式和靶点。最近的研究发现microRNAs(miRNAs)是一类在肾透明细胞癌中发挥重要调控作用的分子。miRNA的表达谱变化不仅与ccRCC的肿瘤发生和复发密切相关,它们在ccRCC组织中的特异性表达还提供了重要的临床诊断依据。因此,对于ccRCC预后相关miRNA的系统鉴定将有助于为ccRCC的早筛和治疗提供新的靶点。在本研究中,基于TCGA以及GEO数据库中收集的522例肾透明细胞癌患者的miRNA预后表达谱和临床信息,通过共识分子亚型鉴定(CMS)、主成分分析(PCA)及t分布-随机邻近嵌入(t-SNE)等方法,申涛博士鉴定出两类新的ccRCC分子亚型。而这两种亚型具有完全不同的临床表现、病人总生存率和分子图谱特征。在机制上,该研究发现不同亚群之间的差异表达基因(DEGs)主要富集在跨膜运输相关的过程中。此外,该研究还发现了一个以miRNA为中心的DEGs调控网络,该网络在物质跨膜运输和ccRCC发生发展中发挥重要调控作用。总结来看,本研究描述了ccRCC癌症之间的分子异质性,为ccRCC诊断和预后提供了潜在靶点,并为miRNA调控网络在ccRCC进展中的作用提供了新的见解。
本论文基于分子酶学与重大疾病机理研究安徽省重点实验室、基因疾病与健康生物医学重点实验室提供的平台和资源完成。同时受到了太阳成集团tyc539博士科研启动经费的支持。
原文链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmolb.2022.967934/full。