近日,我司2020级研究生韩师韵以第一作者身份发表了两篇植物系统进化方面的高水平科研论文:“Plastome evolution of Aeonium and Monanthes (Crassulaceae): insights into the variation of plastomic tRNAs, and the patterns of codon usage and aversion”发表于植物学科国际主流刊物《Planta》(IF=4.540,中科院二区);“Plastomes of Bletilla (Orchidaceae) and Phylogenetic Implications”发表于生物学科Top期刊《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208,中科院二区),太阳成集团tyc539均为第一单位和通讯单位。韩师韵为我司2020级生物学专业硕士研究生,指导教师为阚显照教授。
莲花掌属(Aeonium)隶属于虎耳草目景天科,其地理分布主要集中在世界上生物多样性最高的热点地区之一:马卡罗尼西亚群岛。由于该属所在的加那利群岛上发生了适应性辐射(Adaptive evolution),植物在植株形态、生态和生理方面表现出高度的多样性,莲花掌属因而被喻为“植物界的达尔文雀”,是研究岛屿植物适应性辐射的一个理想的模式类群。然而,该属属内系统发育关系争议严重,种间关系亟待解决。本研究首次报道了9个莲花掌属物种和4个魔南属物种的质体基因组数据,并对其结构及进化模式进行了比较分析。研究发现,基于质体supermarker的数据分析,能够较好地解决莲花掌属内部系统发育关系的争议。此外,质体突变热点区域(hotspots)、IR边界处的特殊结构、pttRNA特殊的二级结构、蛋白编码基因的密码子使用(CUB)和弃用模式(CAM)具有很强的系统发育意义,能够作为植物DNA barcoding的新型标记。该研究成果发表于《Planta》。
原文链接:https://link.springer.com/article/10.1007/s00425-022-03950-y。
此外,韩师韵同学在白芨属(Bletilla)的系统发育研究中也取得了突破性进展。白芨属隶属于兰科龙嘴兰族,且具有重要的药用价值。基于质体基因组数据研究发现,白芨属为非单系类群,华白及应从白芨属中分离出来单独成属。该研究成果不仅有利于深入探讨白芨属系统发育关系,还为兰科植物的进化研究奠定了基础。该研究成果发表于《International Journal of Molecular Sciences》。
原文链接:https://www.mdpi.com/1422-0067/23/17/10151。